Buenas PpLopez!
No entiendo muy bien eso de los arreglos, pero por lo que puedo deducir tienes un problema de reserva de memoria. Si hay valores que se guardan mal, sólo se me ocurre o que la implementación de la convolución tiene algún error o bien que no has reservado espacio para guardar estos valores: por ejemplo que estás guardando floats y en realidad necesitas doubles o bien que no has reservado el espacio suficiente en la tabla que guarda los resultados y estás accediendo a una zona de memoria no reservada.
Quizá si detallaras un poco más podría serte de más ayuda.
Un saludito!
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