Aplicación con privilegios de administrador

[alquimista]

A mi me ocurrió algo similar.

Efectivamente como han comentado un usuario limitado no tiene permiso para escribir en muchas carpetas, ni tampoco en muchas claves del registro de Windows (HKLM-Key Local Machine).
Lo mejor es grabar en carpetas que tienen permisos tanto para admin como limitados. Por ejemplo c:\documents And Settings\Alluser\Datos de programa\MIAPLICACION.
O bien grabar en claves del registro de Windows como HKCU.Clave de Usuario Actual.
Con respecto a las carpetas, puse un truco de como "Obtener carpetas especiales".

Otra manera que intente y no me funcionó es utilizar un procedimiento RunAs para desde un usuario limitado ejecutar la aplicación con privilegios de Administrador.

Espero que te sirva...