Registros de una tabla que no se encuentren en otra

[Ruben_Cu]

Hola Ignacio, puedes usar el predicado Exists(para eso está concebido), te pongo un ejemplo que pudieras adecuar a tu proyecto sacado de la ayuda de SQL.

SELECT O.OrderNo, O.CustNo
FROM Orders O
WHERE EXISTS
  (SELECT C.CustNo
   FROM Customer C
   WHERE (C.CustNo = O.CustNo))

En tu caso sería utilizar NOT EXISTS para obtener los regristros que no existen además de agregarle la condición del campo booleano que comentas.
Saludos