Puedes crear un procedimiento y le llamas cuando proceda para que te cierre todo lo que creas conveniente.
Código Delphi
[-]
Procedure Cierra_Conexiones();
begin
Try
MiQuery1.Close;
LoqueSea.Close;
except
end;
end;
Por lo que veo, quizás te convenga más un bucle que recorra todas las tablas y consultas y vaya cerrándolas una a una.
Un Saludo.