Select un poco jodida!!

[pedrohdez]

Pues con un select anidado, no sera lo mas rapido pero te dara la información,

select DNI, fecha, hora, etc from Asistencias
where DNI in (SELECT DISTINCT Dni, COUNT(*) AS NumAsis
FROM Asistencias
WHERE Fecha BETWEEN '01/01/2000' AND '01/01/2003'
GROUP BY Dni
having COUNT(*)>50)
order by DNI, Fecha, Hora

Aunque el DISTINCT que tienes en el select, no que hace, si ya has agrupado por DNI, no hay duplicados, asi que el distinst es totalmente redundante.