Servicios Windows y Thread con OCR

[Paulao]

Mira, necesito hacer una mejoria en un software semana que viene y no lo se aun como hacer. Este es el cenario.
Hay que hacer vários scanner de vários documientos por dia(300 o mas), generando un archivo OCR. Esto ya se lo hace manualmente. Lo que deve ser hecho ahora es:
Crea un servicio Windows. Y quando este servicio for startado, deve se iniciar una Thread y dentro desa Thread comienzar los scanners de los documentos y la generacion de ellos. Y deve ser asi: Sy un documento for 90% o mas de calidad, este esta aprobado si no, es desechado(descartado, no se se es asi q escribe) y vulve a ser scaneado nuevamente. Todo debe ser automatico, sin la presencia de mano. Impiezó el Windows Service, si abre una Thread y si lo hace. Ellos quieren en una Thread, para que la aplicación no se queda paralisada mientras se va haciendo el scaneamiento de las imagens. Una Thread con prioridad baja.
No se como se hace estas cosas. Mi gustaria de una ayuda de los maestros deste forum. Gracias desde ahora!!