Codigo PHP fragmentado a lo largo...

[papulo]

Me asalta una duda, cuando copio codigo PHP entre el HTML, el servidor lo trata como si estuviera todo junto, ¿no?
Es decir, yo quiero incluir una llamada a la biblioteca en un fragmento de codigo, pero esa llamada y la inclusion de las funciones que he programado, las podre utilizar en cualquier codigo PHP de la pagina, aunque no este dentro del mismo <?...?> que la llamada include. ¿Correcto?