Hola,
yo estoy introduciéndome ahora en Java (lenguaje y plataforma de desarrollo) y, tanto para J2EE y EJB, te recomiendo, si no lo has hecho ya, descargarte toda la documentación que puedas de las páginas de Sun al respecto:
J2EE:
http://java.sun.com/j2ee/index.jsp
EJB:
http://java.sun.com/products/ejb/index.jsp
Seguro que también existe buena bibliografía (externa a Sun) sobre estos temas, pero no he visto la suficiente para poder recomendarte.
Saludos.