Hola Helbert, bienvenido a los foros.
Aunque yo sea el Administrador de los foros, piensa que hay muchas más gente que sabe del tema y te aseguro que muchos de ellos bastante más que yo.
Para comprender lo que estás haciendo y cómo se puede mejorar, primero debes explicar cómo estás haciendo actualmente la importación de Datos desde la tabla plana a SQL Server.
¿Lo estás haciendo desde un programa Delphi? ¿Qué componentes estás utilizando? ¿Utilizas transacciones?
Estaría bien que colocaras algo de código.