[jachguate]

Hola Erika.

Empezado por erika.martinez

blastall -p blastx -d globins -i fugu_globin>resultados_test

Veo que el programa aceptaba parámetros, y que la salida es escrita en la consola. Esta información al inicio nos hubiera evitado unos cuantos rodeos...

Empezado por erika.martinez

Params son los parámetros de entrada - salida

Params son los parámetros de entrada.... no existe tal cosa como los parámetros de salida

Empezado por erika.martinez

pero es necesario que el programa a ejecutar tenga parámetros de salida para poder obtener una salida

Estas segura de lo que estas diciendo... ya me estas haciendo dudar...

Empezado por erika.martinez

yo hubiera podido ejecutar directamente el programa en vez de usar un archivo bat, habria sido:

ExecuteFile('blastall', '-p blastx -d globins -i fugu_globin>resultados_test', 'c:/ncbi-blast\sequence' , SW_SHOWNORMAL)

pero esto Delphi no me lo aceptaba, no sé porque.

Es que quien hace la redirección indicada por el ">" la realiza el interprete de comandos y no el programa que ejecutas. Pero esto, si queres dejar de depender del .bat tiene una solución: Invocar al interprete de comandos.

Ahora no recuerdo exactamente el parámetro, pero creo que era /C

algo como:

Código Delphi [-]
ShellExecute(Application.Handle, 
  pchar('open'), 
  pchar('c:\windows\system32\cmd.exe'), 
  pchar('/c blastall -p blastx -d globins -i fugu_globin>resultados_test'),
  pchar('c:\ncbi-blast\sequence'));

debiera funcionar. Date cuenta que ahora mandamos a ejecutar el interprete de comandos y via parámetros le indicamos cual es el comando a ejecutar: en este caso, el blastall mas la lista de parámetros y por último la redirección. Esto es equivalente a escribir la cadena en una sesion del interprete.

Ojo, que el interprete de comandos es mejor leerlo de la variable de entorno COMSPEC, puesto que su ubicación y nombre varia entre instalaciones y versiones de windows.

Otra posible solución es mediante un PIPE del sistema redireccionar directamente la salida del programa y recogerla en un TStrings, por ejemplo. Para ello te recomiendo consultar los mensajes en este mismo foro y la ayuda de la función CreateProccess del api de windows.

Ambas soluciones son mas complicadas en principio que el bat, pero te dan independencia de este.

hasta luego.