Creo que tu enfoque complica un poco las cosas... si vos mismo diseñas los formularios de las preguntas, simplemente podes poner unas marcas de referencia... digamos un par de líneas horizontales y un par de verticales en cierta posición de la página. Luego de ubicarlas en la imágen, podes por geometría, determinar si el color de ciertas áreas es obscuro o claro, y de allí deducir cuales fueron las respuestas dadas.
Es solo una idea...
Hasta luego.