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Yo primero intentaría hacerlo de forma manual con un editor hexadecimal, tal y como ha comentado ecfisa.
Si eso te funciona y es lo que necesitas (que no lo tengo claro), entonces puedes crear un ejecutable que te haga ese trabajo de forma automática.
Se trata de cargar el EXE como un fichero binario y modifiar los bytes concretos. Revisa la ayuda de la clase TFileStream, que creo que te puede servir para hacerlo.
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