Si no necesitas entorno gráfico, entonces puedes instalar la que quieras, viene a ser casi lo mismo. En esos casos yo instalo ubuntu server, que va sin entorno gráfico y al instalarlo te pregunta si quieres que sea un servidor de ficheros/impresión, servidor de base de datos, etc. sólo has de marcar lo que te interese y se hace la instalación sola. Pero ya te digo, casi cualquiera te vale.
Edito: también es muy interesante
FreeNas, es una instalación mínima de freebsd que está pensada para hacer de NAS, te vendría perfecta, ocupa poquísimo y es muy cómoda y potente, instala la última versión estable.