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Bueno, dejame decirte como trabajo yo, yo uso un paquete Apache+Mysql+PHP, donde lo instalas y queda todo configurado, ya que es mas facil que instalarlo todo individual, entonces, para manejar la base de datos yo utilizo el phpMyAdmin que ya trae el paquete, tal vez cuando usas el EMS manager, el servidor Mysql lo ve como una maquina mas, ˇojo!, nunca usado el EMS for Mysql aunque si conozco su interfaz ya que es la misma que el de EMS for Interbase/firebird.
El paquete que uso es AppServ.
Saludos
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