no es el programa en si... sino el usuario que corre el programa. Las claves del registro que estarán accesibles a este (asi como los archivos y otros recursos) dependen del usuario que inicia la tarea.
Si podes ver la clave en el regedit con tu usuario, no hay ninguna limitación para que cualquier otro programa corriendo en este entorno pueda leer sus valores.
Hasta luego.