[[enecumene]]

Bueno, gracias a ixMike por su ayuda pude hacer el siguiente codigo (aunque es mejorable, pero sirve):

Código Delphi [-]
var
  Incio: TIncio(Form);
  Contador: Integer;

procedure Tincio.FormCreate(Sender: TObject);
var Contador, TiempoBloqueo: Integer;
begin
  Contador:=0;  
end;

en el OnTimer del Timer:

procedure Tincio.Timer1Timer(Sender: TObject);
begin
Inc(Contador);
if Contador = 5 then
  begin
    ShowMessage('El sistema se bloqueó');
  end;
end;

en el OnMessage de un ApplicationEvents:

procedure Tincio.ApplicationEvents1Message(var Msg: tagMSG;
  var Handled: Boolean);
begin
if
  ((Msg.message >= WM_MOUSEFIRST) and (Msg.message <= WM_MOUSELAST))
  or
  (Msg.message >= WM_KEYFIRST) and (Msg.message <= WM_KEYLAST)
  then
    begin
      Contador := 0;
    end;

Saludos.