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Pues no comentas qué tipo de búsquedas utilizas, pero la premisa más importante para agilizar una búsqueda es utilizar índices; Así que te interesaría mucho saber cómo van y utilizarlos.
Luego te recomendaría que utilizaras filtros para minimizar el número de registros que devuelve la consulta.
Normalmente los querys serán mejores ya que puedes controlar mejor cuantos registros obtienes (filtro, TOP).
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