"arrancar automáticamente un programa" puede significar muchas cosas...
¿es un daemon?
¿requiere de un entorno gráfico?
¿Alguno en particular?
En fin... si usas KDE y queres que el programa se inicie después del inicio de sesión, podes crear un script que lo levante y ubicarlo en ~/.kde/Autostart
El script adjunto, por ejemplo, levanta automáticamente el reproductor xmms:
Código:
#!/bin/bash
/usr/bin/xmms -p
Si en lugar de KDE usaras Gnome, entonces el script lo pones en /usr/share/gnome/autostart