Que tal si una vez generado el fichero haces un Copyfile con ese fichero desde la carpeta de archivos generados a la de archivos de salida?
Código Delphi
[-] CopyFile(PChar('c:\TXT\FicherosGenerados\Fichero1.txt'), PChar('c:\TXT\FicherosDeSalida\Fichero1.txt'), False);