Hola.
A menos que estes intentando implementar algo de AJAX (cosa que no creo), veo que tenes un problema de concepto aqui:
javascript se ejecuta en el cliente, por tanto, no tiene forma de saber lo que hay en el servidor. Bueno, si la tiene, pero será mucho mas complicado: podes conectarte via ftp a tu servidor y obtener la lista de carpetas, por ejemplo.
Si queres una lista de carpetas del servidor, será mejor que realices un script del lado del servidor (por ejemplo con php) o un cgi (por ejemplo con delphi) que te devuelva la lista de carpetas disponibles.
Hasta luego.