Con copiar la base de datos de windows al servidor linux y una vez en este poner los permisos del la base de datos correctamente (usuario y grupo firebird con acceso de lectura y escritura) debe de funcionar.
Luego acordarse de en el ordenador cliente de modificar la ruta del directorio para que apunte al nuevo directorio donde se aloja la base de datos y cambiar tambien el servidor, acuerdate tambien que el linux es sensible a mayusculas y minusculas cuando pongas el nombre de la base de datos
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