Buenas y santas.
Primero un comentario al márgen: existen por invocación divina unas etiquetas CODE.. para que tu texto salga formateado y sea más leible. Pero eso se los dejo a los moderadores.
En cuanto a tu cuestión los abrevia toman el archivo hasta donde fueron modificados por última vez, aunque hay programas que bloquean el archivo porque graban constantemente y ahí existe el problema. Pero eso pasa con cualquier compresor.
Yo probaría con:
Código Delphi
[-]
StoreOptions := (soRecurse + soFreshen);
O bien hecharía un vistaso a la documentación (web en: sourceforge.net/projects/tpabbrevia/) que explica muy bien como utilizar a los componentes. Creo que también tienen una propiedad ExtractOptions o similar, quizás cuando descomprimís no la estás parametrizando bien.
Lamento no poder ser de mayor ayuda puesto que hace años que no toco la parte de compresión.