Si entendi bien lo que quieres hacer la sentencia se debiera ver algo como (con sample data, claramente):
Código SQL
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CREATE TABLE #EntradasSalidasECS (
EntradaSalidaECSId int,
TipoEntrada varchar(20),
TipoSalida varchar(20),
FechaEntrada date,
FechaSalida date)
CREATE TABLE #EntradasSalidasBEA (
EntradaSalidaBEAId int,
TipoEntrada varchar(20),
TipoSalida varchar(20),
FechaEntrada date,
FechaSalida date)
INSERT INTO #EntradasSalidasECS VALUES
(1, 'E1', 'S2', '2017-01-01', '2017-01-02'),
(2, 'E1', 'S2', '2017-02-01', '2017-02-02'),
(3, 'E2', 'S2', '2017-03-01', '2017-03-02'),
(4, 'E3', 'S1', '2017-04-01', '2017-04-02')
INSERT INTO #EntradasSalidasBEA VALUES
(1, 'E2', 'S1', '2017-05-01', '2017-05-02'),
(2, 'E1', 'S1', '2017-06-01', '2017-06-02'),
(3, 'E2', 'S3', '2017-07-01', '2017-07-02'),
(4, 'E2', 'S3', '2017-08-01', '2017-08-02')
SELECT
*
FROM (
SELECT * FROM #EntradasSalidasECS
UNION ALL
SELECT * FROM #EntradasSalidasBEA) t1
WHERE
t1.TipoEntrada = @TipoEntrada AND
t1.TipoSalida = @TipoSalida AND
t1.FechaSalida BETWEEN @FechaSalidaDesde AND @FechaSalidaHasta
t1.FechaEntrada BETWEEN @FechaEntradaDesde AND @FechaEntradaHasta
Pero claramente si las dos tablas son tan similares hay un error de diseno... La solucion real seria fusionar las dos tablas y agregar un campo de 'Tipo de Movimiento' que haga referencia a una nueva tabla donde almacenas ECS, BEA... (para seguir con el ejemplo).
Saludos.