buen día Marcelo...
Se me ocurre que trabajes con un archivo bat que se ejecute en modo silencioso y a través de éste mueves y administras tus archivos. la idea seria utilizar la funcionalidad "ejecutar como otro usuario", el problema de este comando (RUNAS) es que no acepta que se pasen contraseñas.... pero
aqui te dejo un link en el que explican como podria simularse la digitacion de la contraseña del otro usuario.
Editado:
Acabo de dar con unos foros que mencionan la utilidad
PsExec que permite hacer este trabajo pasando la contraseña.
Te recuerdo que la idea es que muevas, copies, crees y elimines archivos a través de DOS... la lectura y admon ya la harias desde tu applicacion. Es decir, mueves con el otro usuario los archivos que necesites a una carpeta que tu app pueda leer, allí los editas y los vuelves a pasar al directorio protegido...
saludo,