Perdón se me olvidó el contenido de booststrap.php (tiene un include), aquí os lo dejo, tiene muchas más cosas de las necesarias porque lo utilizo de forma estándar.
Código PHP:
<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8" />
<link rel="stylesheet" href="js/jquery-ui.css" />
<link rel="stylesheet" href="css/bootstrap.min.css"/>
<link rel="stylesheet" href="css/jasny-bootstrap.css"/>
<link rel="stylesheet" href="css/main.css">
<title>Documento sin título</title>
</head>
<body>
<script src="js/jquery-ui.js"></script>
<script src="js/jquery.autotab.js" type="text/javascript"></script>
<script src="js/bootbox.min.js" type="text/javascript"></script>
<script type="text/javascript" src="js/es.js"></script>
<script type="text/javascript" src="js/ajax_class.js"></script>
<script type="text/javascript" src="js/ajax.js"></script>
<script type="text/javascript" src="http://code.jquery.com/jquery-1.10.2.min.js"></script>
<script src="js/bootstrap.min.js" type="text/javascript"></script>
<script src="js/bootstrap-datepicker.js"></script>
<script type="text/javascript" src="js/jasny-bootstrap.js"></script>
<script type="text/javascript" src="js/jquery-3.1.0.min.js"></script>
</body>
</html>