Hola, perdoname la tardanza es que ando con un par de líos encima.
Bueno, de una forma simple no podés ejecutar un programa en un servidor Linux desde Window$. Pero podrías distribuir el GSEC bajo Win y pasarle el parámetro de la BD como IP y alias del servidor supongo ("supongo" = jamás lo hice):
gsec -user sysdba -password <CLAVE> -database <ALIAS_BD>
Estoy con escaso tiempo, pero en cuanto me haga un rato y si ésto no te vale vemos de revisar algo más.
Saludos!