Parece que en ningún momento filtras la tabla POBLACION. Por eso el planner la lee completamente.
Suongo que te da los resultados repetidos tantas veces como poblaciones tengas en esa tabla.
Código SQL
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SELECT A.Codigo, A.Nombre, RDB$GET_CONTEXT('USER_TRANSACTION', 'MUNICIPIO') Municipio,
RDB$SET_CONTEXT('USER_TRANSACTION', 'MUNICIPIO',
(SELECT DISTINCT Municipio FROM Mesas WHERE CodPrv = B.CodPrv AND Codigo = B.Mesa))
FROM Partidos A, Resultados B, Poblacion C
WHERE
A.CodPrv = :PrvIns AND
A.Codigo > 0 AND
A.CodPrv = B.CodPrv AND
A.Codigo = B.Partido AND
B.Proceso = :Proceso
Esto podría escribirse con JOINs de la siguiennte manera:
Código SQL
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SELECT A.Codigo, A.Nombre, RDB$GET_CONTEXT('USER_TRANSACTION', 'MUNICIPIO') Municipio,
RDB$SET_CONTEXT('USER_TRANSACTION', 'MUNICIPIO',
(SELECT DISTINCT Municipio FROM Mesas WHERE CodPrv = B.CodPrv AND Codigo = B.Mesa))
FROM Partidos A
JOIN Resultados B on A.CodPrv = B.CodPrv AND A.Codigo = B.Partido
JOIN Poblacion C on 1=1
WHERE
A.CodPrv = :PrvIns AND
A.Codigo > 0 AND
B.Proceso = :Proceso
No entiendo qué es lo que buscas con las partes CONTEXT.