Con respecto a tu aplicación, y una vez instalado y funcionando Ubuntu, podrías usar el emulador
wine.
La idea será utilizar la librería embedded, para eso copia tu aplicación, la base de datos y la librería fbembed.dll (renombrada como fbclient.dll) todo junto en cualquier directorio de tu Ubuntu.
Instala después con synaptic el programa wine.
Una vez hecho lo anterior, ve al directorio donde está tu aplicación, click derecho sobre ella y elige abrir con wine.
Por cierto, aquí tienes una guia bastante buena de Ubuntu, espero que te ayude:
Curso Ubuntu Completo