[ecfisa]

Hola gonza.

Si pones la propiedad ShowCheckBox en True y la propiedad Checked está en False no te va a permitir hacer cambios.
Esta esta última propiedad es la que te permite o no, realizar cambios.

Para despejar toda duda relizá esta prueba:

Código Delphi [-]
procedure TForm1.FormShow(Sender: TObject);
begin
  with DateTimePicker1 do
  begin
    Kind:= dtkTime;     
    Format:= 'HH:mm:ss';   // formato 24 hs
    ShowCheckBox:= True;   // mostrar casilla de verificación
    DateTimePicker1.Checked:= True; // el componente está seleccionado 
  end;
end;

Verás que si hacés click sobre la hora, minutos o segundos te permite realizar los cambios sin problemas.

Saludos.