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Que tal,
Mira, no se si tu aplicacion la entregas con un instalador, o bien tu la instalas de manera "manual", en cualquiera de los casos, lo mas facil y práctico es que dicho proceso de instalacion sea el que copie una base de datos "vacia" pero que ya contenga toda informacion como tablas,triggers, sp, etc ... De esa manera no lo tienes que hacer desde tu aplicacion.
Ahora bien, si tu aplicacion va creciendo y requiriendo nuevos campos, tablas, etc, te recomiendo que crees en tu programa un modulo actualizador de la base de datos, asi cada vez que te veas forzado a "actualizar" tu aplicacion con clientes ya en funciones, y la "nueva" version ya usa nuevos campos o tablas, entonces desde este modulo ejecutas los scripts necesarios para actualizar la base de datos (estos scripts te recomiendo los pongas en un archivo de texto para que pueda ser actualizable conforme tu aplicacion crece).
Saludos.
PD: Espero haberme hecho entender ...
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