UPs..... hilo de hace 2 meses...
y 1 año 
Creo que todos andamos un poco perdido con estas cosas nuevas.
El DNIe se puede usar en windows para hacer login, Tienes el lector de tarjetas inteligentes conectado, enciendes el ordenador y se queda esperando a que alguien se identifique (por usuario y contraseña o por DNIe); cuando alguien introduce el DNIe en el lector, se valida el usuario (logon en windows) y se permite la entrada.
Lo que él quiere hacer es lo mismo pero en Linux.
Edito: Primera búsqueda y aparece kriptopolis, no he leído el artículo, pero creo será interesante
http://www.kriptopolis.org/autentica...etch-gnu-linux