Hola,
Creo que tienes que "jugar" con los distintos valores que puede tomar la propiedad "Position" del formulario. Fíjate, por ejemplo, que si esta vale "poDesktopCenter", aunque se modifiquen en tiempo de diseño las propiedades "Top" y "Left" del formulario, cuando este se muestre en pantalla aparecerá centrado en el escritorio. Echa un vistazo a ver y nos dices cómo te va.
