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System32 esta en el PATH del sistema por lo que cualquier ejecutable que coloques ahí, lo puedes invocar desde la línea de comando desde cualquier ruta en forma directa.
Por otra parte, en el FileExists() no coloques la ruta directa, sino que la variable del sistema.
Por ejemplo para la carpeta de Windows sería %windir% lo mismo para system32. Puedes buscar la lista completa en Google colocando variables sistema windows o buscar información sobre como hacerlo mediante WMI.
No se que problemas habras tenido con Avast pero al igual que este, Avira permite excluir el escaneo de archivos o carpetas. Pero no es recomendable para nada hacerlo, ya que los malwares se alojan y "crean" ahí.
Parte desinfectado el sistema:
- Corre CCleaner, tanto archivos como registro de Windows.
- Luego corre Malwarebytes.
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