Desde php no podras interactuar en ninguna forma con el cliente, sino solo basicamente en el servidor.
Para abrir archivos locales, creo que solo te basta con poner en la referencia del enlace 'file://ruta', en vez de http. Ya para abrir en una ventana nueva, solo tendrias que cambiarle el target:
Algo como:
<a href="file://c:/program files/" target="_blank"> Directorio Program Files </a>