Si la aplicación que quieres "controlar" la hiciste tú quizá se pueda establecer un mecanismo de comunicación entre ambas para facilitar las cosas. Pero si se trata de una aplicación externa entonces es muy posible que debas implementar un
hook o gancho del teclado a nivel de sistema.
Un gancho del teclado es un procedimiento que te permite monitorear toda la actividad del teclado que se realice en el sistema. Puedes ver un ejemplo de ello en la unidad
hooks.pas de mi página. Para más información te recomiendo que busques el tema de hooks en la ayuda del SDK de Windows.
Además de detectar la actividad del teclado tendrás que poder determinar de qué aplicación proviene un evento para filtrar sólo los de la aplicación que te interesa.
Creo recordar que en alguna ocasión se habló de esto en los foros. Mira a buscar hooks en la opción de búsqueda a ver si encuentras algo más.
// Saludos