Hola,
Es que no sé muy bien a qué te refires. Lo cierto es que instalé Aptana vía Eclipse, y lo hize omitiendo el "soporte para la depuración"... ahora entro en las opciones de Aptana en
Eclipse y no veo dónde puedo mirar eso que dices... la verdad. Aunque, desde luego te digo que yo no utilizo el "depurador de JavaScript" en Aptana. Digamos que para el JavaScript que necesito me basto con la extensión
FireBug para FireFox.