Supongo que estamos hablando del programa "agent", si no recuerdo mal, que no lo hago
En el código encontraras una función tal que así:
Código Delphi
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function Bajar(Url: string; Archivo: string): Boolean;
Esta función baja un archivo de un http o ftp y lo guarda en el disco duro, pues solo tienes que reemplazar esa función por la que necesites para obtener los archivos del "servidor de aplicaciones". No estoy seguro, pero si el programa esta colocado en una carpeta compartida se podría usar la instrucción Copyfile, corregirme si me equivoco, solo tendrías que tener en cuenta a la hora de hacer los archivos de inicio que donde antes era una url ahora seria la dirección del archivo en formato UNC