Yo diría que esto no es posible ya que detrás de los iconos del escritorio sólo hay transistores y resistencias, por decirlo de alguna manera.
Es decir, el escritorio realmente es un control listview con estilo lvsIcon de manera que colocar una aplicación detrás de dichos iconos sería como meterla en ese listview. Y detrás de ese listview pues está el cinescopio del monitor
// Saludos