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Un order by implica que la computadora tiene que ordenar los registros, y eso consume tiempo, y cuantos mas articulos haya mas tiempo necesitara la computadora, no es lo mismo ordenar solo 2 articulos que 10.000.
Si ademas tienes joins, la cosa se puede complicar mucho mas.
La solucion para este tipo de problemas consiste en algo basico en sistemas de bases de datos y que todo programador que se precie debe conocer perfectamente: tener previamente ordenados los registros por los campos que interesen.
Esto es lo que hacen los indices de las bases de datos y para lo que se usan: para que los ordenamientos y busquedas no se eternicen.
En definitiva hay que estudiar las queries que el sistema vaya a utilizar, y en funcion de ellas crear los indices adecuados que aceleren estas queries.
Saludos
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