El método Loaded se va a ejecutar tanto en diseño como en ejecución. Quizá no al momento de insertar la componente por vez primera en el formulario pero sí las siguietes veces que abras el proyecto. Para distinguir si el código se está ejecutando durante el diseño puedes usar:
Código Delphi
[-]
if csDesigning in ComponentState then
En cuanto a lo de que se ejecute despúes de que el formulario principal se cargue completamente, como dice
rfernandez, tendrás que ser más específico pues no se entiende muy bien lo que deseas.
// Saludos