Vamos a ver, yo de Kylix no sé nada, pero según la documentación puedes hacer uso de condicionales del compilador para código específico para una u otra plataforma. Ejecutar un exe sólo podrás hacerlo en Windows, así que pienso que podrías usar algo como:
Código Delphi
[-]
{$IFDEF MSWINDOWS}
WinExec(...);
{$ENDIF}
// Saludos