Si las dos bases de datos estan registradas, puedes hacer la consulta cruzada entre bases de datos, antecediendo a la tabla el prefijo con el nombre de la base de datos:
SELECT basedatos1.dbo.Tabla1.campo
Algo como:
Código:
SELECT A.Nombre, B.Salario
FROM Basedatos1.dbo.Tabla1 A
INNER JOIN Basedatos2.dbo.Tabla2 B ON A.campocomun=B.campocomun