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Hola,
detalle importante: Cuando dices que lo ejecutas directamente en el servidor... ejecutas tu aplicación desde el servidor, no? Yo creo que lo mejor sería que intentases algún update directamente desde el Query Analyzer a ver qué te hace.
Otra cosa interesante sería que esta actualización la realizaras mediante un Stored Procedure para descartar que se trate de los componentes ADO.
Temas relacionados con ADO:
Qué tipo de cursor utilizas? Has Probado a utilizar BatchUpdates?
Temas de servidor:
Esta tabla está indexada correctamente? Has verificado el tamaño de la BD? Tienes algun indice clustered? Has utilizado algún plan de mantenimiento para reducir el tamaño de la BD??
Suerte!
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