Si lo pruebas fuera de un servicio usa el almacén de certificados del usuario pero como servicio el usuario será System.
No sé si el usuario System usa su propio almacén o el de la máquina, seguramente su propio almacén.
Prueba a añadir el certificado con la utilidad psexec que te deja abrir aplicaciones como System
https://learn.microsoft.com/es-es/sy...wnloads/psexec
Ejecuta esto como administrador
Código:
psexec -s -i c:\windows\system32\mmc.exe c:\windows\system32\certmgr.msc