Puedes intentar encontrar el identificador de la ventana de la aplicación externa usando FindWindow. Una vez que lo obtengas usas la función SetWindowPos para colocarla siempre visible:
Código Delphi
[-]
const
Flags = SWP_NOMOVE or SWP_NOSIZE;
var
NotePadWindow: HWnd;
begin
NotePadWindow := FindWindow('Notepad', nil);
SetWindowPos(NotePadWindow, HWND_TOPMOST, 0, 0, 0, 0, Flags);
end;
// Saludos