con esta consulta obtienes los registros de la tabla1 que no están o no coinciden con los de la tabla2:
Código SQL
[-]
select tabla1.*
from tabla1
left join tabla2 on tabla2.municipio = tabla1.municipio and tabla2.partido = tabla1.partido
where tabla2.partido is null
Y aquí una variante donde hace la unión de las dos tablas y buscas los registros que no están en ambas tablas
Código SQL
[-]
select *
from (
select *
from tabla1
union
select *
from tabla2
group by municipio, partido
) dat
left join tabla1 on tabla1.municipio = dat.municipio and tabla1.partido = dat.partido
left join tabla2 on tabla2.municipio = dat.municipio and tabla2.partido = dat.partido
where tabla1.partido is null or tabla2.partido is null