Create una simple base de datos sqlite con una tabla en la que guardas el estado de cada casilla
Revisa
este manual para conectar a SQLite con FireDAC
De hecho, yo ahora estoy migrando los archivos .ini a sqlite, es super facil, igual o incluso mas potente, y los "usuarios normales" no van a poder meter los dedos como si podrian toquetear un ini. Y la misma tecnica que se usa para windows en escritorio serviria para cualquier plataforma en la que corra sqlite (en todos lados)
Este
otro enalce tambien te puede servir, solo lo he mirado por arriba, pero parece que implementa una clase que interactua con una BD sqlite como si un archivo .ini se tratase
EDITO:
Otra alternativa, usando
JSON