Este blog detalla muchas de las decisiones y comportamiento interno de windows:
http://blogs.msdn.com/b/oldnewthing/
ReactOS es una reimplementacion de windows:
http://www.reactos.org/es/index.html
Y tambien WINE implementa una interface Win32 sobre POSIX:
http://www.winehq.org/
Y hubo un momento donde parte del codigo fuente de win2000 se publico por hackers:
http://thepiratebay.se/torrent/3497574
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Por otro lado, no especificas para que quieres hacer tal cosa. Nadie puede entender un OS completo del tipo de *nix, osx, windows, etc.
Y conocer un OS no requiere ver el codigo. En tal caso, es posible 100% ser experto en windows sin conocer el codigo fuente.