Puedes decirnos más específicamente que problemas tienes con tu memoria USB?
Pues si son virus (en Windows, obvio) supongo que dispones de un antivirus que haga el trabajo por ti
Tambíen puedes entrar a la memoria USB mediante el EXPLORADOR de Windows que no permite que se ejecute ningún programa al "explorar dicha unidad"
Esto lo recomiendo a cada compañero de la Universidad, pues cada vez que colocan su memoria USB en la compu, estos ingresan directamente en la unidad y ya saben lo que sucede.....
En resumen:
en el teclado oprime (tecla "Windows" + tecla "E")
y en el explorador que te salga al costado izquierdo empiezas a navegar a la unidad deseada.
Saludos
Linux sin virus 