Código PHP:
<?
// Se supone que tienes dos arrays en php de 100 posiciones cada
// uno, llamados $datosx y $datosy en donde guardas coordenadas.
// Así que lo que deberías hacer es usar php para generar el
// código javascript a partir de los datos de tus dos arrays.
// Algo mas o menos así:
?>
<script language="javascript">
var point = new array();
<?
for ($i=0; $i<=100; $i++)
{
echo "point[{$i}]=[new GLatLng( {$datosy[$i]} , {$datosx[$i]} )];\n";
}
?>
</script>